经保税区出口的货物，即报关单上的运输方式显示“非保税区”，有两种业务模式：
一是销售给境外但按客户要求运入保税区仓储后离境；
二是直接出口货物，但需要进保税区拼箱。
这两类经保税区出口的货物在申报出口退税时，新金税三期申报系统中必须要在明细申报表中的“业务类型代码”栏勾选BSQ，否则无法申报。
出口企业在申报运输方式显示“非保税区”报关的退税时，会有疑点提示，提示税务机关审核出境备案清单内容及企业填写的出口日期是否准确。其中这个出口日期，由于24号公告中对这类货物的退税率等是以备案清单的出口日期来判断，因此，出口退税申报系统中要求申报的出口日期是以出境备案清单显示的出口日期来填写。
陆运报关
陆运运输可分为包车和拼车两种方式，一般出口到香港、泰国、越南等地区、国家，都会选择这种运输方式。
陆运报关可以使用整体报关流程来操作，如果货量多，一定要提前准备好各种单证信息。如果货量少，可以与第三方公司合作出口报关业务，比较省时省力。
陆运的报关地点有三个：深圳皇岗口岸、文锦渡口岸、深圳湾口岸。
空运报关
货物空运出口，有快递公司安排报关，大家可以提前准备好报关文件。也可以将清关资料交给快递公司，委托快递公司协助报关。不过需要注意的是，快递公司会收取一定的操作费用。空运的报关地点各机场。
跨境电商出口报关注意事项
在报关之前，不仅需要准备全报关资料，还要注意目的国海关的政策、要求。例如欧美地区国家，大部分都要求木制品进口做熏蒸处理。如果产品没有熏蒸，那么无法顺利完成清关。出熏蒸证外，还需要提供厂检单。
主动向海关申报二次结算价格调整情况。
铁矿砂在国际市场上大部分采用公式定价方式计价结算，国内企业与国外矿山签约的价格随行就市，大多数采用指数合约价。铁矿砂在通关申报时往往使用临时价格申报，受合同定价日期、品质、数量等诸多因素影响，实际成交价格可能发生变化，申报的临时价格可能低于或高于实际成交价格，进而造成漏征或多征税款的情形，需要通过二次申报才能够如实向海关反映实际成交价格。因此，企业在发生二次结算价格调整时，应主动向海关补充申报，配合海关进行后续退补税。