执行功能障碍理论（executive function）。执行功能是个体进行问题解决时所必备的一组神经心理技能，涉及很多目的的指向适应过程（如计划、抑制控制、注意、工作记忆），因此是一种复杂的认知建构。执行功能障碍假说可以较好的解释孤独症儿童的刻板行为。如反复的开关门、抽屉，重复的做某一个动作，或迷恋一些简单无意义的操作。福州小百灵自闭症康复中心。
性统合不足理论（cenal coherence）。也称中心一致性理论。一些学者认为孤独症是一种以信息加工不完善为特征的认知障碍，特别是无法依据文信息构建含义。由于孤独症儿童的注意力经常为常人所忽视的客体表面或个别特征所吸引，对客体语境缺乏注意，结果使信息加工发生在局部而非整体水平上。如较多的孤独症儿童认识大量的汉字，却不能理解由汉字组成的句子或故事。尽管相关证据不多，但是由于该理论涉及孤独症外显学习风格，因此受到很多关注。
他们对疼痛、冷热也不太敏感，不爱交朋友，宁肯独自一人，很少会接触别人的眼睛。对语言的理解表达能力低下，无法理解稍微复杂一点的句子，不会用手势表示“再见”。不会理解和运用面部表情、动作、姿态及音调等。缺乏想象力和社会性模拟，不能像正常儿童一样去用玩具“做饭”、“开火车”、“造房子”。有的患儿语言刻板，代词错用，如“我要”说成“你要”，或将自己称为他。与外界交流困难，不能将生词与其含义相联，用手势而不是语言与人交流。当然，以上所说的都是未经系统训练的孤独症儿童。
提高思维的运用能力。尽量让孩子对相同的物体进行归类，在家长和老师的指导下完成连贯的动作，会寻找丢失的东西，能够记住地点、物品的名称，能够求别人帮助，能够运用学过的知识解决简单的问题。增进基本技能的学习对孤独症儿童进行学习能力的训练，不仅能起到有效促进智力发展和丰富语言的作用，还能很好的加强他们的认知能力。例如我们可以让孩子学会认识方位、大小、多少等等。