微通道反应器特别的结构赋予其一系列的性能，故被应用于许多领域。例如，氨基甲酸酯的多步化学合成可以通过连续性工艺来实现，其中包括分步反应工序和反应步骤间的两步分离工序。通过使用一系列串联的由三个微通道反应器和两个相分离器组成的反应装置，可以在一个紧凑型芯片基的工艺系统中实现溶剂转换、危险中间产物原位生产和消耗、高能量化学品的安全处理以及化学品的小批量生产。因此，可以用于快速及放热反应、工业环境拓展等方面。
微通道反应器作为化学工程学科的前沿和热点方向，逐渐成为聚合物合成的新装备、新工艺与新产品开发的重要平台，得到学术界和产业界的广泛关注。
能够通过微通道反应器实现的化学反应类型很多，目前已成功反应的类型有：硝化反应（芳环硝化、硝i酸酯制备）；低温反应；氟化反应；重氮化反应（重氮化还原、重氮化取代、重氮化偶联等）等。
连续流化学提高了化学反应的效率
连续流动化学系统是一种微通道高通量且易于放大生产规模的反应器，由于传统釜式反应技术要求化学反应的许多条件适应于现有的釜式反应设备，而此项技术能取代传统的低效间隙化的反应釜生产操作，实现有效节能、安全、低碳和环保的连续化合成生产，能够为单个反应或大范围的反应组合提供更具成本效率的解决方案。
此外，反应器提高了化学反应的效率、生产规模放大可行性以及化工过程质量，并可以根据客户的需求满足日产5mL试剂消耗量的化学品筛选，在降低成本的同时，也降低了对环境的影响，以及所生产的产品性能的不稳定性，使得操作昂贵化学药品进行前期优化条件时降低成本。