新生厌氧颗粒污泥的培养周期较长，同时厌氧颗粒污泥的培养条件及运行方式都对污泥的颗粒化进程、结构组成以及终的有机物降解效率有较大的影响，从而制约其在实际中的应用。而对于运行中的厌氧反应器，受金属离子等影响，发生有机负荷中1毒、微量金属离子中1毒等，导致厌氧颗粒污泥发生破碎、絮化，活性大幅降低，从而使反应器的处理效率急剧下降。如何使厌氧反应器内厌氧颗粒污泥重新生成，成为制约企业废水处理及连续生产的难题。
pH值是厌氧处理的又一个重要因素。厌氧过程中 ,水解菌与产酸菌对 pH有较大的适应范围 ,而甲1烷菌则对pH值比较敏感 ,适宜它的生长范围是6.5～7.8。若反应器内废水pH值超过这个范围 ,会引起由于甲1烷菌受到抑制而出现的酸积累等问题 ,因而甲1烷菌的这一特性也就决定了反应器内反应区所应控制的pH值范围。反应器内乙1酸的形成是对pH值影响大的一个因素。
《厌氧颗粒污泥的吸附特性及工程应用》较为详细地阐述了厌氧颗粒污泥的结构、特性、吸附理论基础及相关研究进展，借助生物学手段揭示了厌氧颗粒污泥吸附有机污染物的机理，并就吸附过程进行了吸附动力学模型拟合；同时，从吸附剂、吸附质以及环境条件方面系统地分析了厌氧颗粒污泥吸附有机污染物的影响因素，提出了具有优良吸附性能的厌氧颗粒污泥的特征，总结了厌氧颗粒污泥吸附特性在工程中的应用，具有较强的实用性和参考价值。
粒径2.5mm左右成熟的厌氧颗粒污泥中紧密粘附的胞外聚合物(tightlybound-extracellular polymeric substances, TB-EPS)和松散附着的EPS(loosely bound-EPS,LB-EPS)分别是30.2mg total organic carbon(TOC)·g suspended solids (SS)~(-1)和15.2mgTOC·g SS~(-1)，是接种污泥的1.9倍和2.6倍。研究结果表明厌氧颗粒污泥规模化培养机理是微生物代谢产物EPS的内因和选择压的外因共同作用，EPS中的TB-EPS影响颗粒的大小，LB-EPS影响颗粒的粘结能力和结构强度。